En junio, Messi firmó su primer contrato como jugador del primer equipo, que lo vinculaba con el club hasta 2010 y tenía una cláusula de rescisión de 150 millones de euros, similar a las de Ronaldinho y Samuel Eto’o, jugadores ya establecidos en el plantel. El 30 de agosto, La Liga emitió un comunicado en el que indicaba que el contrato y la cláusula de rescisión aún estaban activos. Pese a que el Barcelona perdió 2-4 en la tanda de penaltis tras un empate 2-2, su desempeño fue tan bueno que, por primera vez, lo ovacionaron cuando fue sustituido y Fabio Capello, DT de la Juventus, le pidió a Rijkaard si no se lo cedía, además de decir en la conferencia de prensa posterior que «Nunca había visto a un jugador con tanta calidad a esta edad y con esa personalidad con una camiseta tan importante».
